Trabzon Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümünün misyonu, bilgisayar ve bilişim bilimleri alanında gerekli olan teorik, teknik ve pratik bilgiye sahip; günümüzün modern bilgisayar yazılım, donanım ve bilgi sistemlerini yaratıcı bir şekilde tasarlayabilecek, gerçekleştirebilecek, yönetebilecek, iyileştirebilecek; kendini sürekli geliştiren, toplumsal ve etik değerlere saygılı, yaratıcılık, girişimcilik, liderlik ve takım çalışmasına yatkın olma özellikleriyle alanını ileriye taşıyan mühendisler yetiştirmek; öncelikli alanlarda bilimsel çalışmalar yapmak ve toplumun gereksinimlerini karşılayan yaratıcı çözümler geliştirmektir.